德牧缺陷
偏离德国牧羊犬繁殖标准，并且影响到牧羊犬的实用性和观赏性，都被视为牧羊犬的严重缺憾。另外，牧羊犬缺少色素沉着、超重、松懈和懒散、定向能力丧失或有缺欠，爪子发育差也将视为有严重缺憾。
1.严重缺陷
上面描述过的不符合工作犬犬种特征的情况均属于严重缺陷。耳朵的缺陷也可以被看作是严重的缺陷：耳朵间的距离较大，折耳，耳窝浅，耳朵软(耳朵直立的不好)。颜色浅，以及给人的整体感觉为明显的不结实、不强壮，都属于严重缺陷。
2.牙齿缺陷
任何非剪刀形式的牙齿结构都是缺陷，但不属于下面所指出的“淘汰缺陷”以外的情况。
3.淘汰缺陷
德国牧羊犬协会(SV)为了保证犬种的质量，规定了以下几点为淘汰缺陷。如果一条犬有一点下列缺陷，则禁止作种，也不能参加狗展和比赛。
性格软弱，好咬人，神经不稳定的犬。
被证实有严重的髋部障碍，这是骨盆发育的缺陷，也可能出现肘关节骨质硬化类似的情况。这两种情况在非常严重时，都被认为不合格，根本不能作种。(这点必须通过照射x光来检查，不可只凭肉眼观察，必须由专门兽医来检查。)
公犬的性器官有问题。只有一个睾丸；一个或两个睾丸停留在腹腔或腹股沟里(随着年龄的增长会影响荷尔蒙的正常分泌，使犬变得凶恶).此外，公犬的睾丸发育不全或者明显大小不一也属于这种情况。
耳朵或尾巴受损伤造成外观的缺陷。
畸形的犬
犬的牙齿缺陷：第3颗前臼齿和另一个牙齿的缺陷；犬齿的缺陷；第4颗前臼齿或第1颗后臼齿或第2可颗后臼齿的缺陷；共有3颗以上牙齿的缺陷。
颌骨的缺陷
有白化病的犬(先天的完全没有或者缺少色素沉淀)。
白色的犬(即使有深色的眼睛和指甲也属于淘汰缺陷)。
长而直的毛(长而软的表面皮毛，且不紧贴--即使带有绒毛，在耳朵和腿上的毛很长，腹部、尾巴的毛丛生。)
长毛(长而软的表面皮毛，且没有底部绒毛，背部的毛从中间向两侧分开，耳朵，腿，尾巴的毛从生。)
耳朵的缺憾: 双耳长在头盖骨两侧过低的位置上。耳朵柔软，耳尖翻卷。
排除缺憾:
1，脆弱的个性和过分的神经质，以及神经性嘶咬。
2，被证明有严重的髋关节病症。
3，单声的嗥叫、哭嚎，睾丸畸形。
4，尾巴和耳朵畸形。
5，犬有残损。
6，犬牙不全。
7，犬爪有残缺。
8，超过或低于德国牧羊犬正常身高标准1厘米。
9，白化病。
10，如果犬的头部毛发是白色的。（当然假如犬的鼻部和眼部的毛发仍是黑色的，则被认可。）
11，长毛犬。（头部的毛发软、长、疏松，特别是耳朵内侧和外侧的毛发过长；前后腿的后部毛发过长；尾巴下部的毛发过长。
12，完全没有表皮绒毛的长毛犬，且犬的毛发从背部中间向身体的两侧下垂。
